1、防止温度过高
储藏温度过高，种子呼吸作用旺盛，会过多消耗自身贮存的营养，降低发芽率，因此要求贮藏种子的环境温度最好在10℃左右，切忌把种子放在火炉较近的地方。
2、控制种子含水量
防霉变关键是控制种子本身所含的水分。禾谷类作物种子含水量为12%～13%，油料作物种子为8%～9%，若含水量过高，则易发生霉变，尤其是花生、大豆、玉米等含油脂和淀粉较多的作物种子更应注意。种子贮藏要彻底清除作物茎叶、杂草、土等杂物，并对贮藏室以及贮藏用具进行严格的消毒，以免种子在贮藏过程中受污染物影响而发霉。种子应该放在干燥、通风处保管，不能和地面直接接触，要用砖、木板等垫起，防止种子受潮。也不能被雨淋和雪盖。
3、避免混杂
不少作物的种子与一般粮食不易区分，稍不注意就会造成种粮混杂。影响来年产量。种子包装袋内外都要贴上标签，标明品种、类型、数量，严防混杂。
4、避免种子窒息
种子不能用塑料袋、腌过菜的坛子或装过农药、化肥的袋子等装种藏种贮存，因塑料袋不透气，种子在袋内被迫进行无氧呼吸，产生酒精和有机酸等有毒物质，杀死种胚，使种子失去发芽能力，同时还引起霉变。
5、切忌忽冷忽热
冬贮在室外的种子，不能因为天气变冷而搬入室内，也不能因为室温过高而把种子搬到室外。忽冷忽热的温度，会影响种子质量，降低种子发芽率。
6、防烟熏
切勿将种子储藏在常有烟熏的地方，以免降低发芽。
7、防腐蚀
注意种子不能与农药、化肥混储种子不能与农药、化肥等同室存放，因许多农药和化肥具有较强的挥发性，挥发出的气体对种子细胞和种胚危害极大，直接影响种子发芽率。
8、勤检查
种子储藏期间要勤检查，看是否受潮、虫蛀、鼠咬、发霉等现象发生。如有应及时采取措施，确保种子安全越冬，同时对冬储种子要勤翻动，一般每隔20天翻动一次，以利通风降温，保证种子质量。